Народився у 1984 році у Донецьку.
У 2007 році закінчив Донецький національний технічний університет за спеціальністю “Розробка родовищ корисних копалин”. Магістр.
У 2009 році здобув освіту у Донецькому національному технічному університеті за спеціальністю “Фінанси”. Спеціаліст.
У 2014 році закінчив Донецький національний університет за спеціальністю “Правознавство”. Бакалавр.
У 2020 році здобув вищу освіту у Херсонському національному технічному університеті за спеціальністю “Публічне управління та адміністрування”. Магістр.
У 2022 році закінчив Національний транспортний університет за спеціальністю “Будівництво та цивільна інженерія”. Магістр.
Протягом 2004 – 2010 – учень гірника з ремонту гірничих виробіток, гірничий майстер, помічник начальника, заступник начальника підземної дільниці вентиляції та техніки безпеки, начальник підземної дільниці з видобутку вугілля, помічник начальника підземної дільниці з видобутку вугілля № 2, заступник начальника підземної дільниці з видобутку вугілля № 1, начальник підземної дільниці з видобутку вугілля № 2 шахтоуправління «Трудівське».
Протягом 2010 – 2011 – начальник підземної дільниці № 1, заступник директора з виробництва шахти «Жовтневий рудник».
Протягом 2011 – 2014 – начальник дільниці конвеєрного транспортування, начальник дільниці з видобутку вугілля № 1 відокремленого підрозділу “Шахтоуправління «Трудівське» державного підприємства «Донецька вугільна енергетична компанія» (м. Донецьк).
У січені-серпні 2015 року – гірничий майстер виробничого структурного підрозділу “Шахтоуправління «Першотравенське», начальник зміни виробничої служби № 2 виробничого структурного підрозділу відокремленого структурного підрозділу «Шахтоуправління імені Героїв космосу» публічного акціонерного товариства «ДТЕК Павлоградвугілля» (м. Павлоград Дніпропетровської області).
Протягом 2015 – 2017 років – головний гірничий по підземному транспорту, директор відокремленого підрозділу «Шахта імені М. І. Калініна», в.о. директора з виробництва, в.о. технічного директора – першого заступника генерального директора управління державного підприємства «Донецька вугільна енергетична компанія».
У 2017-2019 роках – начальник зміни, начальник дільниці шахтоуправління «Дніпровське» «ДТЕК Павлоградвугілля».
У серпні — вересні 2019 року — радник патронатної служби Херсонської обласної державної адміністрації.
З 5 вересня 2019 по 1 березня 2021 року — заступник голови Херсонської обласної державної адміністрації з питань регіонального розвитку, інфраструктури та екології. В команді Юрія Гусєва Сергій Козир відповідав за “Велике будівництво”. Це була на 100% креатура заступника голови Офісу Президента Кирила Тимошенка, який, що не є секретом, заробляв на “Великому будівництві”.
З 3 грудня 2020 по 1 березня 2021 року — тимчасовий виконувач обов’язків голови Херсонської обласної державної адміністрації.
З 1 березня до 26 жовтня 2021 року — голова Херсонської обласної державної адміністрації.
За час роботи в Херсонській ОДА Сергій Козир сформував навколо себе групу вихідців з Донбасу, яку у місцевій політтусовці називають «шахтарі».
На дострокових виборах народних депутатів України по виборчому округу № 184 у вересні 2021 року був висунутий кандидатом від партії “Слуга народу”. Для попередження програшу фавориту виборчих перегонів, Геннадію Лагуті – висуванцю партії “Нам тут жити”, за втручання Офісу Президента України з лідером партії “Нам тут жити”, мером Херсона Ігорем Колихаєвим була досягнута домовленість про “злиття” округу на користь С. Козиря. Напередодні дня голосування Президент України звільнив з посади Сергія Козиря і призначив головою Херсонської обласної державної адміністрації Геннадія Лагуту.
З 16 листопада 2021 року набув повноважень народного депутата України. Входить до фракції партії “Слуга народу”.